Äldsta belägg, öfrahöknum, från år 1323.
Innehades under den katolska tiden av domprosten i Strängnäs. En av de först kända ägaren var friherrinnan Catharina Elisabet Posse född Kurk, på den tiden var Prostökna förenat med Bergshammar. 1820 ägdes Prostökna av Herr Baron Carl Fhilip Sack född 1784 och Fru friherrinnan Jacuette Bennet född 1801.
1835 ägdes säteriet av brukspatron Lars Gustaf von Celsing, som aldrig bodde på gården. 1881 blev J. W. Carlsson i Grönsta, Kloster och handl. Alfred Åkerblom i Eskilstuna ägare, ej bosatta på gården.
1889 ägdes Prostökna av Magnus Petter Svensson, som även inköpte Björkudden, Kyng, Söderlida och Stora Vad.
1917 såldes gården till godsägaren A. Sjöstedt och 1939 till agronom Gösta Marell. 1943 köpte kamrer E. A, Sjölander egendomen.
1969 blev Einar Mattson ägare och dottern Marianne Ränk sex år senare.