Järnas första stationshus, som låg på den norra sidan av järnvägen, var färdigt för inflyttning 1862. Trafiken på Järna station ökade och snart behövdes ett nytt stationshus.

Järnas andra stationsbyggnad togs i bruk 1883 och låg på den södra sidan av järnvägen. Eftersom Järna låg närmast det kungliga slottet Tullgarn fick stationen en kunglig väntsal. Även posten hämtades och lämnades på stationen. Den kungliga posten skickades och hämtades med kurir från Tullgarn två gånger om dagen.

Det sista riktiga stationshuset byggdes 1914 och revs i augusti 1993. Arkitekt var Folke Zettervall och i stationshuset inrymdes två kungliga väntsalar, en för kungen och en för drottningen. Varför de inte kunde dela på en kunglig väntsal kan man undra. 1923 byggdes de kungliga väntsalarna om till poststation. De behövdes inte längre eftersom den nya stationsbyggnaden i Vagnhärad inreddes med en kunglig väntsal. Posten låg i den östra delen av byggnaden. Det byggdes även två nya ställverk, ett omedelbart norr om järnvägsbron och ett i den norra änden av bangården.